L'origine de la médiathèque centrale d'agglomération Emile Zola remonte aux confiscations révolutionnaires. Avec celles-ci arrivent les manuscrits médiévaux de l'abbaye de Saint-Guilhem-le Désert et  du monastère d'Aniane et les collections de la Société royale des sciences de Montpellier.

LES FONDS PATRIMONIAUX
Tout au long du XIXe siècle, des legs et dons nombreux vont enrichir le fonds primitif. On ne peut les citer tous mais comment ne pas faire mention de François-Xavier Fabre et de ses amis Vittorio Alfieri et la comtesse d'Albany (1825), de Charles de Vallat (1884) ou encore Calixte Cavalier (1888). La bibliothèque va devenir tant par la diversité et la qualité de ses collections patrimoniales, l'une des plus riches de province.

Son originalité tient notamment à une forte présence des littératures italienne, occitane, catalane et espagnole, des manuscrits littéraires, de l'histoire et de la civilisation du Languedoc, des arts, de la reliure mais aussi de la  bibliophilie contemporaine. Les livres d'artistes vont en effet se faire une place de choix avec le legs de Frédéric Sabatier d'Espeyran (1965) puis des acquisitions régulières.  Le XXe siècle se termine avec le dépôt du fonds ancien de l'Evêché et de celui du Conservatoire national de région.

LES FONDS LITTERAIRES
 La donation Malet est venue, en 2005, enrichir avec bonheur les fonds consacrés à des écrivains : Joseph Delteil (collection constituée par des achats importants à partir de 1992) et Max Rouquette qui entre 1996 et 2000 offre des manuscrits et tapuscrits.

Un fonds Rabelais, constitué de dons, legs ou acquisitions, rend hommage à l'ancien étudiant de la faculté de médecine de la ville.